115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3542 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  56.29 
 
 		 284 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  54.71 
 
 		 842 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  54.58 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  50.39 
 
 		 275 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  49.61 
 
 		 275 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  48.37 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  36.9 
 
 		 486 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  38.01 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  38.57 
 
 		 691 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  30.34 
 
 		 907 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  30.97 
 
 		 465 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  29.3 
 
 		 475 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  31.89 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.22 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 		 306 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.92 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  30.68 
 
 		 426 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  37.7 
 
 		 320 aa  92  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  29.82 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 		 608 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  34.36 
 
 		 423 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 		 686 aa  89.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 		 394 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  30.49 
 
 		 1321 aa  87  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4545  hypothetical protein  32.98 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.02 
 
 		 627 aa  87  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  32.64 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  27.78 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  28.33 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.81 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  31.32 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  30.99 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  30.18 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  31.71 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  29.65 
 
 		 556 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.95 
 
 		 547 aa  77  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 642 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.58 
 
 		 1290 aa  76.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 641 aa  76.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3037  glycoside hydrolase family 16  33.01 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0766336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  29.08 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  28.35 
 
 		 409 aa  75.5  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3145  glycoside hydrolase family 16  33.01 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  26.59 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2950  hypothetical protein  32.06 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.483524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  29.95 
 
 		 1059 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  35.42 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.7 
 
 		 633 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  28.11 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  30.04 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  26.5 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  29.33 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.81 
 
 		 1694 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.88 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  31 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 		 1332 aa  69.3  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  28.02 
 
 		 883 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  30.86 
 
 		 588 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  28.96 
 
 		 1441 aa  66.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.62 
 
 		 532 aa  65.9  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 		 752 aa  65.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2952  glycoside hydrolase family 16  26.92 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123961  hitchhiker  0.0028074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  27.04 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  31.98 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  27.95 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  22.83 
 
 		 449 aa  62.4  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.81 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  31.64 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  28.57 
 
 		 569 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.22 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  29.68 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3131  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  25.25 
 
 		 694 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  27.37 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.17 
 
 		 912 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  24.78 
 
 		 722 aa  55.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  33.56 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.34 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  26.86 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1119  endo-beta-galactosidase, GlcNAc-alpha-1,4-Gal-releasing  24.39 
 
 		 420 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.308798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.5 
 
 		 884 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  25.74 
 
 		 1028 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  30 
 
 		 539 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  26.33 
 
 		 479 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  27.15 
 
 		 464 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.72 
 
 		 819 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  25.54 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2605  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.2 
 
 		 742 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  26.97 
 
 		 479 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  25.64 
 
 		 467 aa  49.3  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.1 
 
 		 639 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  27.68 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.57 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  23.46 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>