110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0981 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  100 
 
 
334 aa  691    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  45.35 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6178  glycoside hydrolase family 16  37.31 
 
 
329 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  28.95 
 
 
279 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  31.54 
 
 
883 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  33.88 
 
 
291 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.63 
 
 
288 aa  109  8.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  30.8 
 
 
641 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  30.8 
 
 
642 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.93 
 
 
282 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.68 
 
 
627 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  31.4 
 
 
588 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  33.93 
 
 
426 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  29.13 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  28.77 
 
 
281 aa  96.3  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.92 
 
 
1694 aa  95.9  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  31.09 
 
 
1028 aa  95.9  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  31.32 
 
 
1321 aa  92.8  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.55 
 
 
358 aa  92.4  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  32.53 
 
 
289 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.78 
 
 
1290 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  30.8 
 
 
389 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.4 
 
 
819 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  31.97 
 
 
423 aa  89.7  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 
694 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 
556 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  33.2 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  29 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  32.09 
 
 
1059 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  32.99 
 
 
409 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.97 
 
 
633 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  29.04 
 
 
286 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  31.76 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.62 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 
752 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  31 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  30.43 
 
 
286 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  30.04 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.57 
 
 
742 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.84 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  27.21 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.41 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3867  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 
469 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  28.57 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  29.37 
 
 
722 aa  75.9  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  29.92 
 
 
569 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  29.07 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  30.58 
 
 
1441 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  30 
 
 
503 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.47 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  25.66 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  26.2 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  31.77 
 
 
384 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  28.37 
 
 
1918 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  28.86 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 
449 aa  70.1  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.8 
 
 
532 aa  70.1  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  28.09 
 
 
446 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  29.13 
 
 
405 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  27.41 
 
 
276 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  27.24 
 
 
1707 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.73 
 
 
912 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  28.51 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  28.92 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
1332 aa  65.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.49 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.14 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.09 
 
 
547 aa  64.3  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  25.26 
 
 
318 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 
464 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  26.45 
 
 
470 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.06 
 
 
884 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  27.23 
 
 
467 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  29.32 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.94 
 
 
1007 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  26.12 
 
 
479 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.92 
 
 
815 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 
465 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  33.12 
 
 
691 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  28.14 
 
 
394 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 
306 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  25.7 
 
 
539 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  26.02 
 
 
479 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  24.4 
 
 
469 aa  53.5  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 
320 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  25.22 
 
 
475 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.54 
 
 
639 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 
608 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  28.66 
 
 
275 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4126  glycoside hydrolase family 16  29.82 
 
 
281 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0487272 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  21.1 
 
 
477 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 
907 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  32.28 
 
 
842 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  26.75 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>