98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3894 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 688 aa  1429    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.35 
 
 		 698 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  48.43 
 
 		 690 aa  673    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.74 
 
 		 687 aa  743    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  46.07 
 
 		 704 aa  616  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.56 
 
 		 704 aa  516  1.0000000000000001e-145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.11 
 
 		 709 aa  456  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  47.75 
 
 		 463 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  43.6 
 
 		 932 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  43.6 
 
 		 750 aa  422  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  45.69 
 
 		 606 aa  413  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  38.1 
 
 		 638 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  42.67 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.94 
 
 		 487 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  39.82 
 
 		 581 aa  340  4e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  36.36 
 
 		 460 aa  306  7e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  35.94 
 
 		 460 aa  301  3e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  38.23 
 
 		 410 aa  265  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  34.35 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  28.73 
 
 		 436 aa  172  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  28.05 
 
 		 436 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.65 
 
 		 467 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  32.12 
 
 		 435 aa  124  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  28.45 
 
 		 445 aa  119  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  28.74 
 
 		 581 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  28.49 
 
 		 452 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  26.78 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  28.71 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  24.39 
 
 		 674 aa  100  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.95 
 
 		 1289 aa  100  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  28.71 
 
 		 440 aa  99.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  29.22 
 
 		 431 aa  97.8  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  29.89 
 
 		 441 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  31.4 
 
 		 711 aa  93.6  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  26.36 
 
 		 473 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  25.97 
 
 		 485 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  31.07 
 
 		 478 aa  89  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  27.82 
 
 		 415 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  23.62 
 
 		 538 aa  88.2  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  29.36 
 
 		 450 aa  88.2  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  30.54 
 
 		 429 aa  87.8  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  24 
 
 		 474 aa  86.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  26.71 
 
 		 471 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  24.54 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  25.5 
 
 		 596 aa  84.7  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  29.25 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  25.94 
 
 		 340 aa  83.2  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  25.08 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.33 
 
 		 1264 aa  79.7  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.7 
 
 		 1329 aa  78.2  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  46.84 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  26.26 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  25.15 
 
 		 644 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  45.57 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  33.8 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  26.27 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  25.42 
 
 		 490 aa  73.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  26.97 
 
 		 446 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  23.25 
 
 		 627 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  28.25 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  23.7 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  24.91 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.92 
 
 		 805 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  24.13 
 
 		 484 aa  62  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  40 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  23.35 
 
 		 534 aa  59.7  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0992  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.24 
 
 		 1056 aa  58.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  37.84 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.05 
 
 		 1967 aa  55.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  39.19 
 
 		 478 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  31.15 
 
 		 591 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  23.05 
 
 		 532 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  26.32 
 
 		 731 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  43.64 
 
 		 212 aa  52.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  26.88 
 
 		 1588 aa  52.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 652 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  30.15 
 
 		 473 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  36.49 
 
 		 584 aa  51.2  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  28.15 
 
 		 466 aa  50.8  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  44.64 
 
 		 474 aa  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  35.14 
 
 		 606 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  29.7 
 
 		 850 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 		 464 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  30.77 
 
 		 505 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  29.17 
 
 		 515 aa  48.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  31.93 
 
 		 2095 aa  47.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  25.73 
 
 		 1965 aa  47.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  28.46 
 
 		 492 aa  47.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  21.24 
 
 		 951 aa  47.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  28.57 
 
 		 483 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  28.18 
 
 		 1316 aa  45.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  26.47 
 
 		 500 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  27.19 
 
 		 537 aa  44.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  31.09 
 
 		 2095 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.35 
 
 		 712 aa  43.9  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  32.95 
 
 		 780 aa  43.9  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  29.86 
 
 		 663 aa  44.3  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>