33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1171 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 491 aa  1017    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  55.6 
 
 		 502 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1580  large, multifunctional secreted protein  37.45 
 
 		 506 aa  336  5.999999999999999e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.10938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  35.67 
 
 		 669 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  36.18 
 
 		 673 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  34.27 
 
 		 647 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  34.08 
 
 		 722 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  32.02 
 
 		 669 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1439  hypothetical protein  33.54 
 
 		 509 aa  270  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  31.6 
 
 		 663 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000987167  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  31.9 
 
 		 656 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5004  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1010 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5289  cytochrome c class I  25.53 
 
 		 920 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  35 
 
 		 1110 aa  70.9  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  29.83 
 
 		 1143 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  26.01 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.91 
 
 		 1040 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.8 
 
 		 1027 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.5 
 
 		 868 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  29.23 
 
 		 1141 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3063  NHL repeat containing protein  38.16 
 
 		 488 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0732  L-sorbosone dehydrogenase  26.52 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  25.91 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  28.11 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.64 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454131  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  24.42 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 		 1306 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  27.16 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  21.9 
 
 		 864 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  26.19 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  27.67 
 
 		 1137 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  36.07 
 
 		 502 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  30.89 
 
 		 514 aa  43.1  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>