33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1236 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1236  protein of unknown function DUF1037  100 
 
 
239 aa  498  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0127  hypothetical protein  69.79 
 
 
253 aa  340  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4342  hypothetical protein  69.2 
 
 
269 aa  337  7e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  decreased coverage  0.000860336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2950  protein of unknown function DUF1037  65.97 
 
 
249 aa  337  8e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3349  protein of unknown function DUF1037  62.77 
 
 
236 aa  317  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3205  hypothetical protein  61.38 
 
 
267 aa  316  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2202  protein of unknown function DUF1037  63.79 
 
 
240 aa  314  7e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.468062  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3775  protein of unknown function DUF1037  62.77 
 
 
249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2986  hypothetical protein  60.67 
 
 
247 aa  301  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102363  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1570  protein of unknown function DUF1037  60 
 
 
240 aa  296  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2966  protein of unknown function DUF1037  58.82 
 
 
248 aa  291  8e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1353  protein of unknown function DUF1037  63.48 
 
 
247 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0027  hypothetical protein  60.91 
 
 
259 aa  287  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2327  protein of unknown function DUF1037  58.44 
 
 
237 aa  287  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.74481  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0143  hypothetical protein  57.74 
 
 
261 aa  280  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  57.92 
 
 
269 aa  278  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  56.67 
 
 
261 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3808  hypothetical protein  58.11 
 
 
297 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  54.66 
 
 
261 aa  269  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3007  protein of unknown function DUF1037  57.8 
 
 
261 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4439  protein of unknown function DUF1037  55.13 
 
 
240 aa  265  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0057675  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5495  protein of unknown function DUF1037  57.8 
 
 
261 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0242413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3258  protein of unknown function DUF1037  57.8 
 
 
261 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.955275  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5571  trehalose utilization-related protein  58.26 
 
 
261 aa  262  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0388  protein of unknown function DUF1037  57.14 
 
 
260 aa  260  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22301  decreased coverage  0.00488955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3468  hypothetical protein  56.5 
 
 
257 aa  255  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3683  hypothetical protein  53.3 
 
 
249 aa  254  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17810  trehalose utilization protein  54.67 
 
 
266 aa  254  8e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1145  protein of unknown function DUF1037  54.26 
 
 
265 aa  251  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1858  protein of unknown function DUF1037  53.81 
 
 
242 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27080  trehalose utilization protein  49.17 
 
 
261 aa  236  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  45.45 
 
 
233 aa  210  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  25.84 
 
 
233 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>