25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2274 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2274  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.507054 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3547  hypothetical protein  49.79 
 
 		 262 aa  224  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  27.27 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  28.9 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  27.09 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  29.71 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  29.71 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  29.63 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  23.98 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  27.48 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  27.27 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  24.15 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.87 
 
 		 478 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  31.19 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.45 
 
 		 1180 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  28.77 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  26.42 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  25.86 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  24.14 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  24.69 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  27.7 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  25.41 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  30.69 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  30.69 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  30.69 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>