28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3547 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3547  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  539  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2274  hypothetical protein  49.79 
 
 
243 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.507054 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  28.99 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  23.58 
 
 
223 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  39.6 
 
 
220 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  39.6 
 
 
220 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  39.6 
 
 
220 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.96 
 
 
1274 aa  58.9  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  30.43 
 
 
213 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  29.01 
 
 
213 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  31.86 
 
 
213 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  24.15 
 
 
217 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  29.58 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.88 
 
 
1180 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.36 
 
 
1171 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  29.77 
 
 
214 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2875  hypothetical protein  31.25 
 
 
228 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  30.1 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  28.63 
 
 
392 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.44 
 
 
1265 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  26.4 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.14 
 
 
1503 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  27.78 
 
 
375 aa  46.2  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  24.76 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  23.39 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  24.63 
 
 
214 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  26.06 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  25 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>