26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1078 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1078  Laminin G sub domain 2  100 
 
 		 911 aa  1780    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.476778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  34.9 
 
 		 3907 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  38.15 
 
 		 4357 aa  95.1  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  32.24 
 
 		 714 aa  85.9  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  32.14 
 
 		 3273 aa  64.3  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  29.34 
 
 		 339 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  25.54 
 
 		 4761 aa  60.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  30.52 
 
 		 1150 aa  58.9  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  27.84 
 
 		 2066 aa  58.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  27.31 
 
 		 1009 aa  57.8  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1759  BNR/Asp-box repeat-containing protein  35.96 
 
 		 571 aa  55.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00340531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  28.64 
 
 		 1565 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  33.33 
 
 		 406 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1916 aa  52.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  37.96 
 
 		 1577 aa  49.7  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.92 
 
 		 306 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1504 aa  49.3  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  29.82 
 
 		 401 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  28.66 
 
 		 364 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.44 
 
 		 265 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  26.25 
 
 		 793 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.58 
 
 		 1035 aa  47  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  28.03 
 
 		 309 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  27.62 
 
 		 6678 aa  44.7  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  28.57 
 
 		 1159 aa  44.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  24.38 
 
 		 369 aa  44.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>