28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1542 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  94.74 
 
 
669 aa  1297    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  100 
 
 
667 aa  1364    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2698  glycoside hydrolase family 5  49.46 
 
 
390 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  42.39 
 
 
763 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2802  glycoside hydrolase family 5  38.54 
 
 
677 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461879  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4673  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.31 
 
 
406 aa  226  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06427  Endo-beta-1,4-mannanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ53]  37.9 
 
 
399 aa  221  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293049  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  34.78 
 
 
1050 aa  211  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  35.79 
 
 
381 aa  211  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.307067 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03358  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT7]  34.03 
 
 
383 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725351  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09276  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  39.6 
 
 
381 aa  194  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.49 
 
 
394 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  33.33 
 
 
409 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0788687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6857  glycoside hydrolase family 5  32.21 
 
 
383 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3863  predicted protein  31.25 
 
 
351 aa  159  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125294  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42201  predicted protein  29.85 
 
 
321 aa  151  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4201  putative glycosyl hydrolase  27.75 
 
 
378 aa  151  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1040  mannanase, putative  28.25 
 
 
440 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0509  mannanase, putative  28.35 
 
 
457 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0374435  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4958  endo-beta-mannanase-like protein  24.59 
 
 
429 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.777337  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4036  predicted protein  25.19 
 
 
263 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02709  beta-1,4-endoglucanase (Eurofung)  35.26 
 
 
313 aa  90.9  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0545724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1121  hypothetical protein  27.37 
 
 
523 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.258088  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  24.18 
 
 
600 aa  66.6  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0809  membrane or secreted protein  32.61 
 
 
850 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764502  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0489  membrane of secreted protein  31.9 
 
 
835 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.590507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  25.32 
 
 
404 aa  43.9  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  25.64 
 
 
568 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>