34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2698 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2698  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 
390 aa  801    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  50 
 
 
669 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  49.46 
 
 
667 aa  354  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  45.97 
 
 
763 aa  340  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2802  glycoside hydrolase family 5  43.64 
 
 
677 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461879  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  37.82 
 
 
1050 aa  235  9e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4673  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  38.44 
 
 
406 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06427  Endo-beta-1,4-mannanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ53]  40.06 
 
 
399 aa  216  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293049  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  34.73 
 
 
381 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.307067 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03358  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT7]  33.33 
 
 
383 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725351  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.42 
 
 
394 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09276  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  33.44 
 
 
381 aa  169  9e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  32.41 
 
 
409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0788687 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42201  predicted protein  33.97 
 
 
321 aa  159  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3863  predicted protein  32.25 
 
 
351 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4201  putative glycosyl hydrolase  31.38 
 
 
378 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6857  glycoside hydrolase family 5  30.29 
 
 
383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1040  mannanase, putative  31.48 
 
 
440 aa  123  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4958  endo-beta-mannanase-like protein  28.12 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.777337  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4036  predicted protein  27.31 
 
 
263 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0509  mannanase, putative  28.62 
 
 
457 aa  106  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0374435  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1121  hypothetical protein  24.62 
 
 
523 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.258088  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02709  beta-1,4-endoglucanase (Eurofung)  36.92 
 
 
313 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0545724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0809  membrane or secreted protein  25.73 
 
 
850 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764502  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0889  hypothetical protein  21.54 
 
 
591 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1076  membrane of secreted protein  30.61 
 
 
865 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00939077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00237  membrane of secreted protein  30.33 
 
 
858 aa  49.7  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.674683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3333  membrane or secreted protein  29.59 
 
 
864 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3130  hypothetical protein  28.06 
 
 
868 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0489  membrane of secreted protein  27.93 
 
 
835 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.590507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2585  hypothetical protein  27.84 
 
 
866 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2725  hypothetical protein  26.46 
 
 
866 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0192734  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  28.46 
 
 
568 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  21.77 
 
 
627 aa  43.5  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>