36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0936 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  100 
 
 
600 aa  1230    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4131  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.09 
 
 
635 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 
627 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  29.03 
 
 
640 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  26.76 
 
 
404 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0771  hypothetical protein  23.17 
 
 
422 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0035  hypothetical protein  35.29 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2011  hypothetical protein  24.09 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0491359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4607  hypothetical protein  23.72 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10930  hypothetical protein  23.08 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129027  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  24.18 
 
 
667 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  23.64 
 
 
669 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  23.85 
 
 
409 aa  60.8  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0788687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1185  hypothetical protein  21.79 
 
 
410 aa  60.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09276  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  26.58 
 
 
381 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  28.67 
 
 
381 aa  58.9  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.307067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  26.38 
 
 
568 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2257  hypothetical protein  23.75 
 
 
447 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0508551 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06427  Endo-beta-1,4-mannanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ53]  30.86 
 
 
399 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293049  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5000  hypothetical protein  22.42 
 
 
406 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.4 
 
 
394 aa  54.3  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1078  hypothetical protein  22.42 
 
 
425 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321073 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  25.57 
 
 
1050 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03358  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT7]  26.37 
 
 
383 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725351  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  27.17 
 
 
763 aa  51.2  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4673  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.35 
 
 
406 aa  50.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0195  hypothetical protein  24.85 
 
 
429 aa  50.4  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2802  glycoside hydrolase family 5  29.28 
 
 
677 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4958  endo-beta-mannanase-like protein  23.73 
 
 
429 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.777337  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0982  hypothetical protein  26.09 
 
 
361 aa  47.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14820  hypothetical protein  21.06 
 
 
443 aa  47.4  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00902064 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  25.11 
 
 
670 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4036  predicted protein  28.83 
 
 
263 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4201  putative glycosyl hydrolase  23.79 
 
 
378 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3863  predicted protein  25.21 
 
 
351 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  22.62 
 
 
686 aa  45.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>