16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3440 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3440  hypothetical protein  100 
 
 		 1439 aa  2966    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1414 aa  589  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1764  hypothetical protein  30.93 
 
 		 1079 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00516909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3498  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1386 aa  106  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4548  hypothetical protein  25.09 
 
 		 659 aa  98.6  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546791  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  26.74 
 
 		 2278 aa  96.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1303 aa  89.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1765  hypothetical protein  24.49 
 
 		 349 aa  84.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  25.61 
 
 		 774 aa  60.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  26.09 
 
 		 691 aa  49.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  44.44 
 
 		 792 aa  49.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  31.4 
 
 		 243 aa  49.3  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  38.64 
 
 		 1750 aa  47.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  30.26 
 
 		 801 aa  46.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03245  hypothetical protein  30.95 
 
 		 406 aa  45.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>