17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1764 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1764  hypothetical protein  100 
 
 
1079 aa  2175    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00516909  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3440  hypothetical protein  30.93 
 
 
1439 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  29.77 
 
 
1414 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3498  hypothetical protein  31.19 
 
 
1440 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309515  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4548  hypothetical protein  25.68 
 
 
659 aa  141  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546791  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  29.77 
 
 
2278 aa  123  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  28.35 
 
 
1303 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  28.12 
 
 
1386 aa  104  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  29.64 
 
 
774 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  29.94 
 
 
691 aa  68.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1765  hypothetical protein  30.21 
 
 
349 aa  65.1  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  36.75 
 
 
792 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4317  hypothetical protein  39.56 
 
 
620 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  36.36 
 
 
595 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  36.36 
 
 
588 aa  49.3  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  31.45 
 
 
1750 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  44.07 
 
 
990 aa  45.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.245505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>