45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05870 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1070 aa  59.3  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1024 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  31.4 
 
 		 669 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  40.96 
 
 		 1083 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  35.14 
 
 		 461 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  31.71 
 
 		 416 aa  52.4  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  37.33 
 
 		 1337 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  30.19 
 
 		 1441 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  28.12 
 
 		 549 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3440  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1439 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.59 
 
 		 665 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  27.27 
 
 		 1063 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 580 aa  48.9  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3958  Fibronectin type III domain protein  30.34 
 
 		 662 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  33.33 
 
 		 654 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  29.49 
 
 		 1433 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  38.36 
 
 		 874 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  26.32 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  30.38 
 
 		 1437 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  25.64 
 
 		 595 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  25.64 
 
 		 588 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  28.72 
 
 		 755 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  31.91 
 
 		 861 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  35 
 
 		 1342 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  40.32 
 
 		 614 aa  45.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  31.51 
 
 		 937 aa  45.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  28.41 
 
 		 1348 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  27.54 
 
 		 571 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  25.23 
 
 		 1174 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  30.53 
 
 		 558 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  26.32 
 
 		 1141 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1969  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.643947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  27.63 
 
 		 341 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  29.23 
 
 		 843 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  27.66 
 
 		 957 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  32.58 
 
 		 2690 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04105  hypothetical protein  35.59 
 
 		 349 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  28.26 
 
 		 528 aa  42.4  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  36.49 
 
 		 933 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_002950  PG0626  hypothetical protein  30.38 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  30.38 
 
 		 461 aa  42.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  24 
 
 		 927 aa  42.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  29.41 
 
 		 495 aa  42  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12818  hypothetical protein  27.59 
 
 		 192 aa  42  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.562782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>