34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03270 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  100 
 
 
1070 aa  2158    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  27.22 
 
 
1441 aa  59.7  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  33.72 
 
 
243 aa  59.7  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  34.56 
 
 
1118 aa  59.7  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  22.4 
 
 
1031 aa  55.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  34.72 
 
 
726 aa  55.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  24.09 
 
 
1154 aa  54.3  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  32.91 
 
 
416 aa  52.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  33.98 
 
 
2690 aa  53.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03245  hypothetical protein  34.83 
 
 
406 aa  52.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  35.44 
 
 
461 aa  51.6  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.34 
 
 
1679 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  28.28 
 
 
927 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  32.94 
 
 
654 aa  50.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  34.83 
 
 
549 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  29.47 
 
 
669 aa  49.7  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  30.84 
 
 
465 aa  49.3  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07560  thermolysin precursor  30.33 
 
 
1250 aa  49.3  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  27.97 
 
 
984 aa  49.3  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0740  hypothetical protein  25.61 
 
 
282 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.821545  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  35.53 
 
 
1302 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  36.25 
 
 
957 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12818  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  47  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.562782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  37.31 
 
 
1527 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  31.94 
 
 
536 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  31.82 
 
 
528 aa  46.6  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  34.52 
 
 
2042 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  25.25 
 
 
571 aa  46.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3105  hypothetical protein  31.33 
 
 
787 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.667845  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  26.6 
 
 
1059 aa  45.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  32.95 
 
 
1389 aa  44.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  27.27 
 
 
874 aa  44.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  40.28 
 
 
617 aa  44.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  29.35 
 
 
1394 aa  44.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>