More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05045 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  42.49 
 
 
957 aa  735    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  100 
 
 
937 aa  1920    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  38.16 
 
 
990 aa  557  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  34.98 
 
 
958 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  27.69 
 
 
560 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  41.33 
 
 
541 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  25.55 
 
 
552 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.84 
 
 
561 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  26.46 
 
 
590 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 
552 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 
593 aa  135  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  40.43 
 
 
630 aa  135  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.05 
 
 
606 aa  135  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  36.51 
 
 
551 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.46 
 
 
587 aa  133  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  26.11 
 
 
637 aa  132  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4560  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30 
 
 
600 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  29.52 
 
 
607 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1790  alpha-amylase  27.4 
 
 
624 aa  124  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.890851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.2 
 
 
621 aa  124  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.32 
 
 
612 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.65 
 
 
610 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  26 
 
 
554 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.85 
 
 
623 aa  120  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1490  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.22 
 
 
610 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.227729  normal  0.484955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1983  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.74 
 
 
611 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236935  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  34.63 
 
 
592 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.96 
 
 
618 aa  120  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.16 
 
 
596 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.97 
 
 
604 aa  119  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4408  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.81 
 
 
601 aa  119  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.354382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.02 
 
 
605 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.89 
 
 
586 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.39 
 
 
605 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  27.4 
 
 
625 aa  118  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2984  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.69 
 
 
607 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340631  decreased coverage  0.00906327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  32.97 
 
 
543 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1739  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.57 
 
 
618 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158802  hitchhiker  0.000847686 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2082  alpha-amylase family protein  30.57 
 
 
618 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.05 
 
 
581 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.55 
 
 
587 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4167  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.15 
 
 
588 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423754  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2011  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.86 
 
 
638 aa  115  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.935259  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6325  putative maltooligosyltrehalose trehalohydrolase  26.4 
 
 
589 aa  115  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.45 
 
 
614 aa  114  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1681  Alpha amylase  28.57 
 
 
615 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35 
 
 
630 aa  114  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.37 
 
 
594 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7549  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.91 
 
 
603 aa  111  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.01 
 
 
594 aa  111  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.88 
 
 
594 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.88 
 
 
594 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.73 
 
 
594 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.71 
 
 
634 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  32.99 
 
 
606 aa  110  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2450  putative Alpha-amylase  35.14 
 
 
592 aa  110  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2710  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.48 
 
 
601 aa  110  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  0.0573085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.58 
 
 
672 aa  109  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.89 
 
 
608 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.14 
 
 
592 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.12 
 
 
598 aa  109  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551631  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  30.71 
 
 
580 aa  109  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  33.52 
 
 
606 aa  109  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  30.71 
 
 
580 aa  109  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  30.71 
 
 
580 aa  109  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  30.71 
 
 
580 aa  109  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1735  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.54 
 
 
634 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1347  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.05 
 
 
593 aa  108  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1564  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.54 
 
 
634 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2784  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.74 
 
 
576 aa  108  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.496519  normal  0.888452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6810  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.85 
 
 
605 aa  108  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368114  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.65 
 
 
592 aa  108  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1205  alpha amylase  26.92 
 
 
594 aa  108  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2937  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.16 
 
 
601 aa  108  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  hitchhiker  0.00396871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.08 
 
 
587 aa  108  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.49 
 
 
577 aa  108  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16640  maltooligosyl trehalose hydrolase  30.57 
 
 
633 aa  108  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.0825424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.63 
 
 
587 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4389  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.49 
 
 
636 aa  107  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.39 
 
 
594 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3935  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.18 
 
 
613 aa  107  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0534162  normal  0.77528 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4048  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.18 
 
 
613 aa  107  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.32 
 
 
613 aa  106  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.51 
 
 
621 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2539  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.19 
 
 
626 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000367182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.67 
 
 
642 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2832  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.41 
 
 
601 aa  105  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2267  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.88 
 
 
609 aa  104  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.95 
 
 
587 aa  104  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36580  putative glycosyl hydrolase  25.21 
 
 
583 aa  104  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0581511  normal  0.753137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  32.2 
 
 
600 aa  103  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1601  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.52 
 
 
601 aa  102  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3633  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.46 
 
 
577 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1682  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.25 
 
 
626 aa  102  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.166285  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2278  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.92 
 
 
584 aa  102  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380817  hitchhiker  0.00913073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.59 
 
 
583 aa  101  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0936005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.78 
 
 
629 aa  101  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  31.12 
 
 
640 aa  101  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1971  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.63 
 
 
587 aa  101  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.464532  hitchhiker  0.0000864181 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5428  alpha amylase catalytic region  21.96 
 
 
614 aa  101  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>