16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1969 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1969  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  626  1e-178  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.643947 
 
 
-
 
NC_002950  PG1795  hypothetical protein  26.19 
 
 		 273 aa  67  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  36.62 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  28.75 
 
 		 927 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1608  hypothetical protein  28.09 
 
 		 545 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398397  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_002950  PG2102  immunoreactive 61 kDa antigen PG91  30.95 
 
 		 540 aa  47  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  38.57 
 
 		 933 aa  46.2  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  33.33 
 
 		 937 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2100  immunoreactive 63 kDa antigen PG102  37.68 
 
 		 554 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.586482 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0654  hypothetical protein  27.91 
 
 		 390 aa  43.5  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  31.08 
 
 		 639 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06765  hypothetical protein  27.03 
 
 		 148 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  34.15 
 
 		 1063 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  25.53 
 
 		 595 aa  42.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  32.1 
 
 		 757 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>