18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3715 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3715  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 
514 aa  1055    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0332  hypothetical protein  51.92 
 
 
580 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3227  hypothetical protein  26.46 
 
 
547 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.3502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3677  FG-GAP repeat-containing protein  26.42 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.431632  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  31.61 
 
 
8871 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2761  FG-GAP repeat protein  27.94 
 
 
694 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16659  predicted protein  24.52 
 
 
742 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  24.18 
 
 
760 aa  47.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  23.43 
 
 
404 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  23.11 
 
 
1348 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.61 
 
 
453 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  21.69 
 
 
1337 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  26.82 
 
 
435 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  24.23 
 
 
2528 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.09 
 
 
891 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  24.05 
 
 
1346 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  31.12 
 
 
494 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  23.8 
 
 
1638 aa  43.5  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>