58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5445 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  100 
 
 
1071 aa  2146    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  38.91 
 
 
923 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5787  LmbE family protein  32.16 
 
 
826 aa  101  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462523  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  29.58 
 
 
811 aa  100  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12028  hypothetical protein  29.01 
 
 
830 aa  99.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  36.72 
 
 
839 aa  98.2  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2961  LmbE family protein  27.86 
 
 
843 aa  97.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0537053  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  32.2 
 
 
797 aa  96.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2865  hypothetical protein  34.27 
 
 
833 aa  95.1  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5481  LmbE family protein  30.8 
 
 
825 aa  94.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.048486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0742  LmbE family protein  32.37 
 
 
882 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  28.63 
 
 
930 aa  81.6  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2590  hypothetical protein  33.82 
 
 
768 aa  66.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  26.56 
 
 
1276 aa  65.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  31.25 
 
 
359 aa  62  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  31.28 
 
 
288 aa  61.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  30.81 
 
 
241 aa  60.1  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  30.39 
 
 
309 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  29.05 
 
 
239 aa  58.9  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  29.15 
 
 
239 aa  58.9  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  28.11 
 
 
237 aa  56.6  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  57.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  29.8 
 
 
245 aa  56.2  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  26.97 
 
 
239 aa  56.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  30.32 
 
 
289 aa  55.1  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  27.64 
 
 
256 aa  54.7  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  30.2 
 
 
245 aa  53.9  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  32.93 
 
 
243 aa  53.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  28.12 
 
 
288 aa  53.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  38.16 
 
 
302 aa  51.6  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  28.05 
 
 
240 aa  51.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  28.34 
 
 
304 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  25.79 
 
 
299 aa  51.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  26.6 
 
 
1585 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  29.63 
 
 
1474 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  32.24 
 
 
311 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  29.63 
 
 
1247 aa  48.9  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  30.09 
 
 
1002 aa  48.9  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  29.34 
 
 
246 aa  48.9  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  29.63 
 
 
1217 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  26.14 
 
 
259 aa  48.5  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  27.12 
 
 
303 aa  48.1  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  27.39 
 
 
1141 aa  48.1  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  28.05 
 
 
1275 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  30.65 
 
 
298 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  31.74 
 
 
299 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  30.6 
 
 
300 aa  47.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  25.64 
 
 
242 aa  47.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  27.53 
 
 
244 aa  47.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  30.37 
 
 
293 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  37.84 
 
 
302 aa  47.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  29.45 
 
 
237 aa  47.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  28.74 
 
 
238 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  26.55 
 
 
290 aa  45.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  40 
 
 
244 aa  45.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  26.92 
 
 
243 aa  45.1  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  25.11 
 
 
239 aa  45.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  28.36 
 
 
323 aa  44.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>