41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2961 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12028  hypothetical protein  54.91 
 
 		 830 aa  921    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0742  LmbE family protein  43.03 
 
 		 882 aa  676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5481  LmbE family protein  41.2 
 
 		 825 aa  644    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.048486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  43.99 
 
 		 811 aa  679    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5787  LmbE family protein  44.5 
 
 		 826 aa  701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2865  hypothetical protein  42.76 
 
 		 833 aa  655    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2961  LmbE family protein  100 
 
 		 843 aa  1734    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0537053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  40.1 
 
 		 839 aa  624  1e-177  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  29.28 
 
 		 930 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2590  hypothetical protein  23.61 
 
 		 768 aa  184  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  31.2 
 
 		 797 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  28.62 
 
 		 1071 aa  87.8  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  29.61 
 
 		 923 aa  84.3  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  30.17 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  27.72 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  26.26 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  26.02 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  24.81 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  25.97 
 
 		 309 aa  57.4  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  27.53 
 
 		 288 aa  55.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  24.29 
 
 		 303 aa  54.7  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  25.54 
 
 		 291 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  23.2 
 
 		 359 aa  54.3  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  24.46 
 
 		 328 aa  50.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  29.28 
 
 		 304 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  22.71 
 
 		 293 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  21.08 
 
 		 312 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  26.26 
 
 		 300 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  24.43 
 
 		 290 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  24.43 
 
 		 290 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  23.73 
 
 		 291 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  24.43 
 
 		 290 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  26.38 
 
 		 314 aa  47.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  22.6 
 
 		 299 aa  47  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  23.89 
 
 		 289 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  22.47 
 
 		 288 aa  47.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  25.13 
 
 		 292 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  22.12 
 
 		 303 aa  46.2  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  27.17 
 
 		 305 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  25.67 
 
 		 298 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  25.97 
 
 		 311 aa  44.3  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>