22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2590 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2590  hypothetical protein  100 
 
 
768 aa  1549    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  40.91 
 
 
797 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2865  hypothetical protein  27.84 
 
 
833 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  26.84 
 
 
811 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12028  hypothetical protein  25.45 
 
 
830 aa  211  5e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2961  LmbE family protein  23.61 
 
 
843 aa  185  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0537053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5787  LmbE family protein  33.63 
 
 
826 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462523  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  35.37 
 
 
839 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0742  LmbE family protein  34.84 
 
 
882 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  33.74 
 
 
930 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5481  LmbE family protein  28.67 
 
 
825 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.048486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  34.9 
 
 
923 aa  73.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  27.92 
 
 
1071 aa  61.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  30.06 
 
 
304 aa  58.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  33.33 
 
 
307 aa  57  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  29.47 
 
 
309 aa  52  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  30.81 
 
 
309 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  29.21 
 
 
359 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  44.62 
 
 
311 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  32.52 
 
 
274 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  28.24 
 
 
293 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  27.59 
 
 
291 aa  44.3  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>