29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5787 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5787  LmbE family protein  100 
 
 		 826 aa  1711    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12028  hypothetical protein  43.7 
 
 		 830 aa  675    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0742  LmbE family protein  57.25 
 
 		 882 aa  961    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5481  LmbE family protein  47.11 
 
 		 825 aa  739    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.048486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  48.75 
 
 		 811 aa  760    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  41.43 
 
 		 839 aa  650    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2961  LmbE family protein  44.5 
 
 		 843 aa  701    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0537053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2865  hypothetical protein  44.89 
 
 		 833 aa  742    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  31.74 
 
 		 930 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  26.44 
 
 		 797 aa  227  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2590  hypothetical protein  33.63 
 
 		 768 aa  156  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  32.95 
 
 		 923 aa  97.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  32.77 
 
 		 1071 aa  87.4  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  32.58 
 
 		 304 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  25.47 
 
 		 288 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  30.39 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  28.96 
 
 		 311 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  29.35 
 
 		 290 aa  54.3  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  28.57 
 
 		 293 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  28.11 
 
 		 295 aa  51.6  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  28.49 
 
 		 294 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  27.36 
 
 		 294 aa  50.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  25.84 
 
 		 303 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  27.32 
 
 		 291 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  25.59 
 
 		 314 aa  46.6  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  32.3 
 
 		 245 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  26.67 
 
 		 293 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  25.28 
 
 		 309 aa  45.8  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  23.47 
 
 		 323 aa  44.3  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>