65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3334 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  100 
 
 
930 aa  1904    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  33.3 
 
 
811 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5787  LmbE family protein  31.64 
 
 
826 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462523  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0742  LmbE family protein  31.72 
 
 
882 aa  361  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2865  hypothetical protein  30.72 
 
 
833 aa  353  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12028  hypothetical protein  30.33 
 
 
830 aa  349  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  30.86 
 
 
839 aa  348  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2961  LmbE family protein  29.46 
 
 
843 aa  343  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0537053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5481  LmbE family protein  35.77 
 
 
825 aa  244  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.048486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  34.01 
 
 
797 aa  137  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2590  hypothetical protein  33.74 
 
 
768 aa  128  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  33.12 
 
 
923 aa  78.6  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  33.52 
 
 
309 aa  73.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  33.14 
 
 
293 aa  73.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  33.71 
 
 
288 aa  72  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  32.95 
 
 
359 aa  70.5  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  32.57 
 
 
294 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  28.63 
 
 
1071 aa  69.7  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  27.08 
 
 
288 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  31.32 
 
 
293 aa  65.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  26.84 
 
 
328 aa  63.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  30.17 
 
 
291 aa  62  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  30.43 
 
 
298 aa  62  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  31.28 
 
 
295 aa  61.6  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  30.56 
 
 
290 aa  61.2  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  29.47 
 
 
316 aa  60.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  33.15 
 
 
300 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  29.78 
 
 
289 aa  60.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  28.89 
 
 
303 aa  59.7  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  29.14 
 
 
303 aa  59.3  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  29.63 
 
 
312 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  32.97 
 
 
286 aa  57.4  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  28.73 
 
 
295 aa  57.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  29.73 
 
 
287 aa  57  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  30.27 
 
 
287 aa  56.6  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  28.42 
 
 
299 aa  56.6  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  28.78 
 
 
291 aa  57  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  27.96 
 
 
301 aa  56.2  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  30.9 
 
 
313 aa  55.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  29.89 
 
 
240 aa  54.7  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  28.65 
 
 
291 aa  55.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  30.77 
 
 
307 aa  54.7  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  28.96 
 
 
301 aa  54.7  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  30.73 
 
 
292 aa  53.9  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  26.45 
 
 
330 aa  53.9  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  29.28 
 
 
295 aa  53.5  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  26.2 
 
 
288 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  29.53 
 
 
309 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  28.96 
 
 
290 aa  52  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  29.74 
 
 
314 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  26.67 
 
 
276 aa  49.7  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  30.23 
 
 
245 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  28.57 
 
 
213 aa  49.7  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  29.78 
 
 
290 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  29.9 
 
 
302 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  29.78 
 
 
290 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  29.78 
 
 
290 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  30 
 
 
303 aa  49.3  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  28.26 
 
 
245 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  31.87 
 
 
305 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  29.08 
 
 
294 aa  48.5  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  29.55 
 
 
241 aa  47.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  31.25 
 
 
246 aa  47.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  29.26 
 
 
323 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  26.84 
 
 
239 aa  44.7  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>