199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  100 
 
 		 241 aa  482  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  61.75 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  46.47 
 
 		 242 aa  201  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  51.94 
 
 		 239 aa  185  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  47.44 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  45.34 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  46.86 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  48.06 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  45.53 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  45.87 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  45.81 
 
 		 243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  41.85 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  48.46 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  44.17 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  49.51 
 
 		 243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  47.85 
 
 		 239 aa  144  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  38.46 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  39.22 
 
 		 240 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  39.51 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  37.33 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  34.47 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  32.84 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  32.14 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  45.52 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  34.62 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  35.04 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  38.24 
 
 		 423 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  34.8 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  30.69 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  30.69 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30.69 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  32.79 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  36.24 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  32.31 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.46 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.52 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  30.17 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  31.84 
 
 		 311 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.12 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  28.95 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  28.36 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  28.36 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  28.36 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  32.77 
 
 		 923 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  31.82 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  36.54 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  25.41 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  33.51 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  31.79 
 
 		 1071 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  31.91 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  29.73 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  31.37 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  25.84 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  27.72 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  31.33 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  32.14 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  28.19 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  29.2 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  32.82 
 
 		 298 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  28.5 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  32.33 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  33.09 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  29 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  29.55 
 
 		 930 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  33.03 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  31.91 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  30 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  33.98 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  39.42 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  29.67 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  29.25 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  27.13 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  32.26 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  22.52 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  30 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  30 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  27.89 
 
 		 283 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  30 
 
 		 293 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  29.95 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  30.82 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  31.68 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  26.46 
 
 		 300 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  27.93 
 
 		 294 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  26.63 
 
 		 302 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  28.3 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  28.43 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  28.57 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  30.56 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  30 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.6 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  29.32 
 
 		 283 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  28.04 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  26.92 
 
 		 323 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  28.18 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>