246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1525 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  100 
 
 		 244 aa  500  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  89.92 
 
 		 245 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  63.04 
 
 		 234 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  46.72 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  47.18 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  50.43 
 
 		 241 aa  185  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  42.8 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  43.23 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  41.45 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  43.89 
 
 		 237 aa  162  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  45.73 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  41.7 
 
 		 239 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  45.08 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  45.6 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  36.97 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  41.05 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  39.41 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  40.09 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  36.18 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  40.61 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  37.38 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  37.24 
 
 		 245 aa  121  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  38.36 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  38.79 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  34.8 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  35.32 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  36.92 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  36.89 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  34.91 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  39 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  34.91 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  35.82 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  39.9 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  32.93 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  33.33 
 
 		 237 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  36.84 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  32.53 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  32.53 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  32.53 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  32.53 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  32.53 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  32.53 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  32.53 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  32.13 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  32.53 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  33.47 
 
 		 281 aa  93.2  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  34.19 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  37.25 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  31.33 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  34.01 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  35.53 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  31.43 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  32.64 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  28.68 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  35.18 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  35.38 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  28.44 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  27.54 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  26.89 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  33.5 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  26.89 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  26.89 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  28.91 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  29.58 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  26.96 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  43.08 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  36.41 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  37.3 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  30.47 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  29.56 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  29.7 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  28.29 
 
 		 311 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  32.21 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  29.26 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  31.18 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  30.81 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  30.77 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  28.22 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  30.93 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  30.43 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  31.65 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  25.85 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  31.65 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  28.5 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  28.5 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  31.12 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  28.02 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  31.13 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.62 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  30.9 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  30.04 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  29.02 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  29.86 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  27.94 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  27.64 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  27.94 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  32.09 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  35.51 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  31.12 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  28.71 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>