176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0630 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  100 
 
 		 240 aa  494  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  58.67 
 
 		 276 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  32.44 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  25.85 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  34.19 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  30.96 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  28 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4210  LmbE family protein  33.57 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  26.39 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  30.49 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  32.41 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  25.42 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  36.45 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  35.78 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  28.21 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  28.36 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  29.2 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  23.83 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  25.26 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  31.45 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  32.31 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  26.72 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  27.18 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  31.78 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  32.31 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.87 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  34.27 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  25.85 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.54 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  24.63 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  24.63 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  24.89 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  24.89 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  26.71 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  26.87 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  27.31 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  24.89 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  26.37 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  29.38 
 
 		 299 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  30.23 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  31.85 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  30.4 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  30.92 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  31.48 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  23.53 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  25.93 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.37 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.37 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  28.47 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  29.37 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.37 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.37 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  27.98 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.84 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  37.8 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  29.46 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  25 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  28.36 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  25.53 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  27.78 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  25.83 
 
 		 309 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.47 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  33.61 
 
 		 266 aa  52  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  26.32 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  28.14 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  25.11 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  30.53 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1423  LmbE family protein  21.7 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  32.33 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  24.53 
 
 		 423 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  23.97 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  27.89 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  36.17 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  25.31 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  28.47 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  30.58 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  30.84 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  30.56 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  32.54 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  23.67 
 
 		 295 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  23.65 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  25.6 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  24.9 
 
 		 293 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  24.15 
 
 		 258 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  27.06 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  30.36 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  25.13 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  30.36 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  25.13 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  25.13 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  25.85 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  32.06 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  28.43 
 
 		 464 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  29.46 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  25.37 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  30.36 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  26.17 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  25.13 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  30.36 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  25.13 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>