180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0201 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  100 
 
 		 277 aa  557  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  43.5 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  40.23 
 
 		 462 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  42.13 
 
 		 464 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  39.08 
 
 		 502 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  42.72 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  36.73 
 
 		 252 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  39.27 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  38.22 
 
 		 464 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  35.83 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  38.81 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  41.55 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  36.24 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  41.55 
 
 		 251 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  37.22 
 
 		 708 aa  122  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  36.11 
 
 		 471 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  33.18 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  40 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  38.81 
 
 		 251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  39.06 
 
 		 261 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  33.79 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  36.96 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  36.54 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  39.47 
 
 		 447 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  31.66 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  34.9 
 
 		 244 aa  85.5  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  30.54 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  35.6 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  35.6 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  33.33 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0905  hypothetical protein  29.15 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  34.19 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  36.91 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  28.51 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  34.9 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  29.44 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  33.08 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  34.11 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  25.65 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  28.4 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  26.8 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  26.8 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  37.7 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  25.66 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  35.66 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  28.99 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  30.15 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  26.53 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  31.94 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  31.45 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  27.62 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  30.71 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  29.94 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  35.07 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  34.39 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  25.54 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  30.05 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  26.47 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  30 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  33.08 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  28.09 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  26.83 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  31.62 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  31.62 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  32.85 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  33.87 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  31.11 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  30.15 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  31.62 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  37.8 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  34.96 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  23.72 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  32.28 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2689  LmbE-like protein  28.48 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  31.09 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  31.34 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  31.34 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  27.24 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  32.88 
 
 		 223 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  32.54 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  35.19 
 
 		 223 aa  53.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  32.58 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.04 
 
 		 236 aa  52.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  21.88 
 
 		 223 aa  52.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  28.89 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  24.48 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  28.08 
 
 		 217 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  28.72 
 
 		 268 aa  52.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  24.35 
 
 		 225 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  26.62 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  26.62 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  26.62 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  26.62 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  26.62 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  26.62 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  29.23 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  29.3 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  30.26 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  26.62 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>