241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2568 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  100 
 
 		 427 aa  832    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  37.25 
 
 		 502 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  36.87 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  37.41 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  35.11 
 
 		 471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  36.41 
 
 		 464 aa  176  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  32.88 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  36.44 
 
 		 708 aa  152  8e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  43.96 
 
 		 208 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  42.86 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  41.76 
 
 		 208 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  37.85 
 
 		 252 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  40 
 
 		 277 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  38.25 
 
 		 199 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  39.43 
 
 		 199 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  38.3 
 
 		 197 aa  118  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  41.27 
 
 		 197 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  41.49 
 
 		 201 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  41.57 
 
 		 191 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  40.96 
 
 		 201 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  38.86 
 
 		 199 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  38.86 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  39.43 
 
 		 199 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  34.72 
 
 		 195 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  37.78 
 
 		 199 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  29.03 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  39.46 
 
 		 207 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  37.43 
 
 		 240 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  34.91 
 
 		 257 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  39.27 
 
 		 198 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 197 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  34.91 
 
 		 257 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  34.17 
 
 		 252 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  37.17 
 
 		 198 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  36.41 
 
 		 260 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  31.87 
 
 		 193 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  36.32 
 
 		 250 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  37.43 
 
 		 203 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  32.77 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  35.85 
 
 		 253 aa  94  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  35.85 
 
 		 192 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  38.58 
 
 		 251 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  38.07 
 
 		 251 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  36.14 
 
 		 202 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  32.24 
 
 		 207 aa  86.7  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  33.73 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  33.1 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  34.42 
 
 		 251 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  37.14 
 
 		 192 aa  82  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  25.33 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  33.86 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  36.06 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  33.51 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  34.72 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  27.39 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  35.56 
 
 		 302 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  32.8 
 
 		 245 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  34.04 
 
 		 245 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  32.63 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  34.31 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  32.8 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  31.54 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  36.96 
 
 		 250 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0905  hypothetical protein  30.67 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  36.23 
 
 		 239 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  27.19 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  31.18 
 
 		 1001 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  37.06 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  33.12 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  41.18 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  36 
 
 		 243 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  25.25 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  31.03 
 
 		 239 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  36.36 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  36.59 
 
 		 288 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  34.46 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  31.58 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  29.7 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  24.29 
 
 		 693 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  24.54 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  28.16 
 
 		 337 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  31.21 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  31.91 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  37.86 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  38.02 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  30.21 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  29.13 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1432  LmbE family protein  46.51 
 
 		 275 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.886775 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  32.09 
 
 		 254 aa  57  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  32.81 
 
 		 221 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 		 1015 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  43.18 
 
 		 311 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  30.29 
 
 		 309 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  32.81 
 
 		 213 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  30.8 
 
 		 316 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  23.23 
 
 		 225 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  28.71 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  25 
 
 		 265 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  22.27 
 
 		 223 aa  54.3  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>