29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10900 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  35.43 
 
 		 197 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  33.49 
 
 		 208 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  37.61 
 
 		 464 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  35.38 
 
 		 462 aa  95.5  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  33.49 
 
 		 208 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  33.18 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  32.24 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  32.89 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  36.06 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  30.56 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  32.24 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  30.73 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  32.24 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  28.14 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  31.84 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  32.79 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  32.11 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  31.66 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  31.28 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  31.19 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  30.37 
 
 		 471 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  30.81 
 
 		 708 aa  64.3  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  33.1 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  32.66 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  30.94 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  39.34 
 
 		 198 aa  42.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>