66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0200 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  47 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  44.5 
 
 		 462 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  45 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  45.88 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  45.5 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  45.31 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  45.59 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  44.57 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  43.48 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  41.27 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  41.43 
 
 		 502 aa  145  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  44.72 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  44.09 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  41.27 
 
 		 195 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  41.53 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  43.37 
 
 		 197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  46.34 
 
 		 464 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  39.62 
 
 		 471 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  40.51 
 
 		 464 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  43.31 
 
 		 203 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  43.82 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  30.93 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  43.26 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  35.94 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  37.11 
 
 		 192 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  43.04 
 
 		 192 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  40.31 
 
 		 192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  42.26 
 
 		 197 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  34.03 
 
 		 447 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  37.43 
 
 		 427 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  39.26 
 
 		 708 aa  98.2  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  36.14 
 
 		 202 aa  95.9  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 1015 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  32.79 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  37.93 
 
 		 1001 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  30.77 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  28.99 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  29.19 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  32.14 
 
 		 378 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 175 aa  45.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.87 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  34.94 
 
 		 397 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  32.76 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  35.29 
 
 		 377 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  34.94 
 
 		 397 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  34.12 
 
 		 377 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  27.37 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  29.76 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  34.12 
 
 		 377 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.89 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  28.17 
 
 		 308 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 220 aa  42  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 220 aa  42  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 220 aa  42  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 220 aa  42  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 368 aa  42  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  25.71 
 
 		 220 aa  42  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  25.71 
 
 		 220 aa  42  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  25.71 
 
 		 220 aa  42  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>