68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1799 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  100 
 
 
265 aa  554  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  40.18 
 
 
208 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  41.18 
 
 
208 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  39.01 
 
 
201 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  39.01 
 
 
201 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  38.57 
 
 
199 aa  151  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  39.27 
 
 
199 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  38.18 
 
 
199 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  38.18 
 
 
199 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  37.39 
 
 
464 aa  142  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  33.33 
 
 
471 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  35.84 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  38.64 
 
 
199 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  32.58 
 
 
464 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  32.46 
 
 
203 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  30.89 
 
 
502 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  32.7 
 
 
195 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  31.96 
 
 
197 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  30.93 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  35.8 
 
 
462 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  33.01 
 
 
708 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
191 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  32.37 
 
 
207 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  33.96 
 
 
192 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  34.38 
 
 
197 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  32.4 
 
 
192 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  31.46 
 
 
197 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  31.82 
 
 
198 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  32.39 
 
 
198 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  32.77 
 
 
427 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  28.89 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  26.9 
 
 
447 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
192 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  28.14 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  29.2 
 
 
190 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
1001 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  29.53 
 
 
209 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  26.63 
 
 
194 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
1015 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
309 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  28 
 
 
331 aa  49.7  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 
175 aa  48.9  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  27.21 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
309 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  27.2 
 
 
309 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.93 
 
 
236 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  25 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  23.19 
 
 
207 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  22.61 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2692  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2586  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  39.58 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.970402  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  22.83 
 
 
339 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  26.67 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  20.45 
 
 
2012 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34303  predicted protein  23.93 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294482  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  22.5 
 
 
263 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.47 
 
 
229 aa  42.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  29.07 
 
 
231 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  27.56 
 
 
189 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  24.73 
 
 
207 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  27.56 
 
 
189 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  39.06 
 
 
374 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37510  hypothetical protein  25.58 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00412109  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  23.3 
 
 
269 aa  42  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0755  hypothetical protein  29.07 
 
 
216 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>