59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5873 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  43.16 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  41.84 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  45.92 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  41.84 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  45.41 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  39.59 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  39.09 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  39.09 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  38.74 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  38.71 
 
 		 462 aa  134  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  39.06 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  38.58 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  31.96 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  35.75 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  42.76 
 
 		 464 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  38.3 
 
 		 427 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  35.94 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  32.99 
 
 		 502 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  39.47 
 
 		 471 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  33.86 
 
 		 191 aa  111  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  34.39 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  38.15 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  35.38 
 
 		 464 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  35.84 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  34.44 
 
 		 447 aa  99.8  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  35.14 
 
 		 708 aa  98.2  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  32.81 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  35.43 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  31.77 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  34.93 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  32.35 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  37.16 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 		 1001 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  31.3 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  32.88 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  25.4 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  31.51 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  24 
 
 		 2012 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0768  methyltransferase type 12  24.65 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  31.51 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  34 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  31.51 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  31.51 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  31.51 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  31.51 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  26 
 
 		 1015 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  31.51 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  31.51 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  29.51 
 
 		 240 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 262 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  28 
 
 		 207 aa  42  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 307 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.12 
 
 		 447 aa  41.2  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>