265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3595 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  52.6 
 
 		 197 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  53.68 
 
 		 198 aa  184  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  53.68 
 
 		 198 aa  181  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  54.74 
 
 		 197 aa  161  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  47.64 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  45.6 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  43.62 
 
 		 195 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  47.4 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  42.93 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  44 
 
 		 447 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  43.29 
 
 		 464 aa  130  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  40.76 
 
 		 462 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  43.66 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  40.54 
 
 		 471 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  43.97 
 
 		 199 aa  121  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  41.36 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  44.87 
 
 		 464 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  38.59 
 
 		 208 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  38.04 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  37.11 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  39.89 
 
 		 502 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  43.88 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  41.61 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  39.78 
 
 		 708 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  33.96 
 
 		 265 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  37.76 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  35.95 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  35.95 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  37.25 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  35.29 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  40.67 
 
 		 1001 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  37.23 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  37.14 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 		 1015 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  39.47 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  31.96 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  31.9 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  34.34 
 
 		 2012 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0366  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.21 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592907  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0443  methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 		 1171 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4580  Methyltransferase type 12  34.38 
 
 		 242 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00650588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  34.65 
 
 		 265 aa  51.2  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3833  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  27.33 
 
 		 2997 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.63 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1968  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.35 
 
 		 698 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  34.95 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2370  protein-glutamate O-methyltransferase  44.68 
 
 		 513 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470912  hitchhiker  0.000464427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  26.42 
 
 		 1914 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  34.15 
 
 		 331 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 262 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 283 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  26.55 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  28 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  35.45 
 
 		 261 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  24.76 
 
 		 263 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 334 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 332 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  26.96 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 264 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  34 
 
 		 300 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.01 
 
 		 238 aa  48.9  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  34 
 
 		 300 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1804  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.67 
 
 		 422 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.399037  hitchhiker  0.0000000665268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  26.28 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  33.96 
 
 		 3275 aa  48.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0549  hypothetical protein  33 
 
 		 226 aa  48.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 262 aa  48.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.28 
 
 		 233 aa  47.8  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  31.68 
 
 		 265 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.21 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 331 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.24 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1282  hypothetical protein  27.97 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  33 
 
 		 300 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.94 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 268 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.68 
 
 		 300 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 333 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  36.27 
 
 		 329 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 304 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  32 
 
 		 300 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  33.96 
 
 		 2867 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 330 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 330 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>