22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1282 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1282  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1467  Methyltransferase type 11  78.7 
 
 		 231 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6798  putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  76.96 
 
 		 234 aa  361  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3835  methyltransferase type 12  86.52 
 
 		 231 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2873  methyltransferase type 12  73.48 
 
 		 241 aa  343  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0956  methyltransferase type 12  73.57 
 
 		 231 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2448  hypothetical protein  66.96 
 
 		 284 aa  310  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4580  Methyltransferase type 12  50.22 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00650588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3035  methyltransferase type 12  45.83 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3532  methyltransferase type 12  41.59 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  26.47 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  25.52 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  29.13 
 
 		 2012 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4465  Methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  28.81 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  27.78 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  25.62 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.98 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 348 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  32.95 
 
 		 464 aa  42.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  25.62 
 
 		 199 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  21.13 
 
 		 208 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>