30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6798 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6798  putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1467  Methyltransferase type 11  75.22 
 
 		 231 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0956  methyltransferase type 12  73.57 
 
 		 231 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2873  methyltransferase type 12  72.61 
 
 		 241 aa  347  7e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1282  hypothetical protein  76.96 
 
 		 231 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2448  hypothetical protein  68.7 
 
 		 284 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3835  methyltransferase type 12  74.35 
 
 		 231 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4580  Methyltransferase type 12  47.56 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00650588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3532  methyltransferase type 12  42.04 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3035  methyltransferase type 12  43.78 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  33.64 
 
 		 1914 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.78 
 
 		 7541 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  25.79 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  29.06 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.68 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.43 
 
 		 318 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  25.79 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  25.79 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  26.32 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  30 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  27.27 
 
 		 243 aa  42  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 214 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  30 
 
 		 253 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.86 
 
 		 256 aa  41.6  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>