39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3835 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3835  methyltransferase type 12  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1282  hypothetical protein  86.52 
 
 		 231 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1467  Methyltransferase type 11  76.62 
 
 		 231 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6798  putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  74.35 
 
 		 234 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2873  methyltransferase type 12  73.48 
 
 		 241 aa  338  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0956  methyltransferase type 12  71.37 
 
 		 231 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2448  hypothetical protein  69.13 
 
 		 284 aa  312  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4580  Methyltransferase type 12  48.23 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00650588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3532  methyltransferase type 12  45.13 
 
 		 230 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3035  methyltransferase type 12  46.76 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  26.47 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  31.07 
 
 		 2012 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  28.92 
 
 		 4090 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11528  methyltransferase  34.43 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.084318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  23.85 
 
 		 471 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.78 
 
 		 7541 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3603  hypothetical protein  26.36 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.879922  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  32.32 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  25.13 
 
 		 297 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.41 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 382 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  23.18 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  23.84 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09226  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  32.17 
 
 		 2559 aa  42.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  23.18 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  32.73 
 
 		 2997 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  24.64 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  38.53 
 
 		 267 aa  42  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  23.18 
 
 		 199 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  27.27 
 
 		 203 aa  42  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  29.41 
 
 		 464 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  29.73 
 
 		 255 aa  41.6  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1457  hypothetical protein  27.61 
 
 		 238 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  27.81 
 
 		 658 aa  41.6  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>