21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0956 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0956  methyltransferase type 12  100 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2873  methyltransferase type 12  78.41 
 
 		 241 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1467  Methyltransferase type 11  74.89 
 
 		 231 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6798  putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  73.57 
 
 		 234 aa  351  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2448  hypothetical protein  72.05 
 
 		 284 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1282  hypothetical protein  73.57 
 
 		 231 aa  329  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3835  methyltransferase type 12  71.37 
 
 		 231 aa  287  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4580  Methyltransferase type 12  48.89 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00650588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3532  methyltransferase type 12  42.98 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3035  methyltransferase type 12  47.93 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3603  hypothetical protein  28.7 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.879922  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  29.81 
 
 		 2012 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.84 
 
 		 7541 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  25.64 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  30.84 
 
 		 1914 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.08 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 207 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 207 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>