48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4580 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4580  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 242 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00650588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3035  methyltransferase type 12  73.06 
 
 		 236 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1467  Methyltransferase type 11  48.46 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0956  methyltransferase type 12  48.89 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2873  methyltransferase type 12  47.39 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6798  putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.56 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2448  hypothetical protein  46.88 
 
 		 284 aa  198  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1282  hypothetical protein  50 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3835  methyltransferase type 12  48.03 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3532  methyltransferase type 12  44 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0768  methyltransferase type 12  27.52 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  34.38 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  29.66 
 
 		 1914 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0215  Methyltransferase type 12  24.22 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.647581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  31.32 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  28.81 
 
 		 2012 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3603  hypothetical protein  27.21 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.879922  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1457  hypothetical protein  27.35 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.45 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34303  predicted protein  26.55 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294482  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  27.17 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.04 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  28.24 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  33.76 
 
 		 331 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  32 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  28.79 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  30.61 
 
 		 6999 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.77 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.7 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  25.44 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  30.83 
 
 		 191 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0179  hypothetical protein  26.85 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5457  Methyltransferase type 11  25.21 
 
 		 385 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 331 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 417 aa  42  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  34.71 
 
 		 329 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4222  methyltransferase type 11  22.54 
 
 		 212 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13461  hypothetical protein  21 
 
 		 215 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.861602  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0609  Methyltransferase type 12  37.62 
 
 		 202 aa  42  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.67 
 
 		 247 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  28.33 
 
 		 471 aa  41.6  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>