62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0215 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0215  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 233 aa  484  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.647581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  31.58 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  27.64 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1765  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.751788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 341 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.13 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.32 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.3 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.19 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  25.7 
 
 		 261 aa  45.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  25.6 
 
 		 1424 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3731  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 298 aa  45.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  26.36 
 
 		 415 aa  45.4  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  29.36 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3035  methyltransferase type 12  24.88 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.34 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0252  Methyltransferase type 12  29.36 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.965523  hitchhiker  0.00106675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.07 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.34 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.81 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.81 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3833  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.57 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1467  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  26.12 
 
 		 3639 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  27.52 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  27.52 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  35.63 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0496  hypothetical protein  29.01 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340166 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  27.52 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  27.52 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  27.52 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  27.52 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  27.52 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.24 
 
 		 263 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  21.85 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.11 
 
 		 230 aa  42  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  26.12 
 
 		 203 aa  42  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 260 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  30.77 
 
 		 251 aa  42  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.34 
 
 		 241 aa  42  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  29.82 
 
 		 7785 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  30.6 
 
 		 476 aa  42  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 245 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 247 aa  42  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  25.66 
 
 		 312 aa  42  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  25.19 
 
 		 398 aa  41.6  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 253 aa  41.6  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>