More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3731 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3731  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 298 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1927  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170226  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0585  methyltransferase type 11  24.62 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356128  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.74 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2660  23S rRNA methyltransferase A  34.95 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000543045  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0422  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1707  23S rRNA methyltransferase A  34.95 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000156407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.3 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1704  23S rRNA methyltransferase A  34.95 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000062625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  32 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1747  23S rRNA methyltransferase A  34.95 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00290496  normal  0.326236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1327  hypothetical protein  27.04 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  33.73 
 
 		 726 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  40.58 
 
 		 206 aa  53.5  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 219 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  33.02 
 
 		 400 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1365  hypothetical protein  27.04 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  23.02 
 
 		 227 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 194 aa  52.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 212 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.61 
 
 		 232 aa  52.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  25.76 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0704  methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 170 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0858444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1420  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1386  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.55 
 
 		 201 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_550  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.1 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00760121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1172  hypothetical protein  29.79 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  24.12 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2150  hypothetical protein  29.79 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0280  hypothetical protein  29.79 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1102  methyltransferase  26.61 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1875  hypothetical protein  29.79 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788068  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0885  hypothetical protein  29.79 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1085 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1729  hypothetical protein  29.79 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0374  hypothetical protein  29.79 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1571  23S rRNA methyltransferase A  33.98 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1203  hypothetical protein  28.33 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.322275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  35.64 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1108  methyltransferase  26.61 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18425  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  31.43 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  30.37 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  40.3 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1289  hypothetical protein  26.61 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.471005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1490  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0869674  normal  0.806662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  26.56 
 
 		 638 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  24.09 
 
 		 269 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1128  hypothetical protein  26.61 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  33.61 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  33.61 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1220  hypothetical protein  26.61 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 261 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.81 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.61 
 
 		 258 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.61 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  38.81 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.72 
 
 		 345 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.61 
 
 		 258 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  38.81 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  38.81 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.67 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 214 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  24.43 
 
 		 209 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 261 aa  49.7  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  24.09 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2570  23S rRNA methyltransferase A  31.07 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.69516  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0929  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 251 aa  49.3  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.85 
 
 		 213 aa  48.9  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  31.13 
 
 		 273 aa  49.3  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  22.4 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  25.64 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.27 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2286  23S rRNA methyltransferase A  28.06 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.83 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  37.31 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>