246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48590 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  36.64 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  31.82 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  35.11 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  31.97 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.89 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  32.41 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  29.28 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  26.64 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  33.33 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  28.4 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  35.79 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.45 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  31.78 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.65 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  30.71 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  27.67 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  34.23 
 
 		 333 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  29.6 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  29.6 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  29.6 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  29.6 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  29.6 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  28 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  28 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  28 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  30.47 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  28 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  28 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  28 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  28 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  28.8 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  32.04 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  31.37 
 
 		 326 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  28.8 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.14 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.83 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.62 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.56 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  28.8 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.65 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  28.67 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.56 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.98 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.21 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  28.8 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  31.78 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3731  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 298 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.06 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.04 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.04 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  34.31 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  26.4 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.82 
 
 		 268 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  26.56 
 
 		 199 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  33.65 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 277 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.69 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.94 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.21 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.69 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>