More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3007 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  100 
 
 
246 aa  514  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  41.91 
 
 
249 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  41.98 
 
 
249 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  38.75 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  37.71 
 
 
253 aa  181  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  38.49 
 
 
256 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  36.82 
 
 
250 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
254 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
253 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  38.43 
 
 
248 aa  169  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  36.69 
 
 
254 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  37.08 
 
 
256 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 
255 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  35.44 
 
 
255 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  34.18 
 
 
264 aa  162  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
252 aa  161  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  36.61 
 
 
249 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
246 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  32.92 
 
 
263 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
250 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  33.05 
 
 
250 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
255 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  34.84 
 
 
255 aa  141  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  30.04 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  38.57 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  36.51 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  31.46 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  35.83 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  24.74 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  30.6 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  28.84 
 
 
239 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  36.92 
 
 
257 aa  62  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  28.84 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  28.84 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  31.88 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
634 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.74 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  27.49 
 
 
311 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 
254 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
173 aa  59.3  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  29.21 
 
 
271 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
259 aa  58.5  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
257 aa  58.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.24 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.91 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.87 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  38.14 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
261 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  36.11 
 
 
207 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  29.49 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.69 
 
 
261 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  33.05 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.44 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.69 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  33.62 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  33.62 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.02 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  33.62 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  27.56 
 
 
311 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  31.75 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  31.19 
 
 
405 aa  53.1  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  30.6 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
243 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  27.33 
 
 
311 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  32 
 
 
354 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.92 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
211 aa  52.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
328 aa  52.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  28.89 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
295 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
250 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
250 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  33.62 
 
 
251 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
250 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  23.94 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  31.3 
 
 
304 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>