More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1748 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  511  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  51.43 
 
 
248 aa  250  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  45.6 
 
 
269 aa  239  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  46.5 
 
 
250 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  45.12 
 
 
250 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  46.53 
 
 
254 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  47.15 
 
 
256 aa  228  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  46.77 
 
 
255 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  46.77 
 
 
255 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  45.27 
 
 
250 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  45.97 
 
 
254 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  41.43 
 
 
264 aa  222  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  45.34 
 
 
255 aa  222  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  45.2 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 
256 aa  218  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  41.39 
 
 
252 aa  215  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  43.67 
 
 
250 aa  211  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  39.27 
 
 
256 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  39.27 
 
 
256 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  43.98 
 
 
246 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  43.67 
 
 
249 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  41.87 
 
 
249 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  41.67 
 
 
249 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  42.32 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  37.71 
 
 
246 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  42.45 
 
 
250 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  37.34 
 
 
263 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  37.45 
 
 
255 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  37.78 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  37.78 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  37.78 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  37.04 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  37.04 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  37.04 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  38.93 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  39.23 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  35.56 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  29.58 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  37.6 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  31.68 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.91 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  36.22 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  36.22 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.38 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  30.38 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.38 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.38 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  31.82 
 
 
261 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  30.72 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  36 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.82 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.06 
 
 
261 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  34.68 
 
 
239 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  34.68 
 
 
239 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  35.2 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.23 
 
 
200 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.06 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  34.71 
 
 
255 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  24.81 
 
 
318 aa  58.9  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  31.3 
 
 
263 aa  58.9  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  30.41 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.81 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  31.97 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  32.31 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  31.39 
 
 
261 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.3 
 
 
207 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1927  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
209 aa  56.2  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  32.34 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  26.4 
 
 
267 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.87 
 
 
308 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  35 
 
 
257 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4018  methyltransferase  45.61 
 
 
89 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000287879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  27.39 
 
 
299 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  29.33 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>