74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0591 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  100 
 
 		 326 aa  653    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  60.19 
 
 		 310 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  59.37 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  54.35 
 
 		 338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  48.21 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  36.54 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  38.04 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  36.57 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  35.37 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  38.11 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  38.96 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  37.12 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  37.12 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  41.35 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  35.77 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  35.77 
 
 		 255 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  31.93 
 
 		 561 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  31.93 
 
 		 561 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  39.38 
 
 		 312 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  34.87 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  37.98 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  33.9 
 
 		 456 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  36.18 
 
 		 241 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  33.78 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  35.8 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.41 
 
 		 577 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  35.41 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  26.32 
 
 		 577 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  30.26 
 
 		 447 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  31.21 
 
 		 436 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  31.23 
 
 		 436 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  30.97 
 
 		 456 aa  93.2  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  32.13 
 
 		 439 aa  89.7  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  25.82 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  32.73 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  23.51 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  22.97 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  29.56 
 
 		 200 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.46 
 
 		 232 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  27.48 
 
 		 203 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  32.78 
 
 		 227 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  31.37 
 
 		 248 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  28.74 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  30.48 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 200 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1392  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 204 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.7 
 
 		 236 aa  46.2  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1601  hypothetical protein  36.78 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  30.07 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0284  methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.46 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0256  methyltransferase type 11  36.78 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.3 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  32.9 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  30.52 
 
 		 192 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  28 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  30.07 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  22.45 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  27.22 
 
 		 248 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  26.79 
 
 		 318 aa  42.7  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 767 aa  42.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 219 aa  42.7  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  29.25 
 
 		 214 aa  42.7  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 3145 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  30.88 
 
 		 354 aa  42.4  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  26.74 
 
 		 210 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 253 aa  42.4  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>