More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1075 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  100 
 
 
303 aa  603  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  45.97 
 
 
308 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  48.49 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  44.84 
 
 
329 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  42.52 
 
 
308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  46.13 
 
 
308 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  44.52 
 
 
331 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  44.19 
 
 
331 aa  209  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  44.81 
 
 
315 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  45.18 
 
 
330 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  44.22 
 
 
312 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  38.94 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  36.57 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  37.99 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  37.79 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  37.88 
 
 
324 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  41.2 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  40.8 
 
 
276 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  39.6 
 
 
276 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  32.1 
 
 
561 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  32.1 
 
 
561 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  31.2 
 
 
577 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  35.46 
 
 
456 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  30.83 
 
 
577 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  34.15 
 
 
436 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  38.98 
 
 
241 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  35.95 
 
 
444 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  37.97 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  38.4 
 
 
272 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  36.23 
 
 
447 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  38.15 
 
 
274 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  32.86 
 
 
436 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  34.34 
 
 
456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  32.24 
 
 
436 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  30.84 
 
 
439 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  28.98 
 
 
417 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  24.62 
 
 
358 aa  90.9  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
356 aa  79  0.00000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  21.9 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  27.52 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
266 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  35.09 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  33.1 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  30.77 
 
 
251 aa  59.7  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
269 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1368  methyltransferase type 12  28.67 
 
 
210 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.16 
 
 
246 aa  58.9  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  24.7 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  25.29 
 
 
207 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1601  hypothetical protein  29.1 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0256  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.65 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.46 
 
 
239 aa  57  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
220 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  29 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.3 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 
225 aa  56.6  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
250 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
269 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
209 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  29.73 
 
 
203 aa  56.2  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
271 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
246 aa  55.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  33.33 
 
 
658 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  28.47 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  34.59 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  28.47 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  28.47 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  28.47 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  28.47 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  35.66 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.63 
 
 
213 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.77 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  28.17 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  28.26 
 
 
269 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.96 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
247 aa  54.3  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  29.08 
 
 
269 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  28.26 
 
 
269 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.69 
 
 
238 aa  53.5  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  32.11 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 
244 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 
230 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  29.08 
 
 
269 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.3 
 
 
235 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
261 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.36 
 
 
447 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  26.11 
 
 
255 aa  52.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  27.88 
 
 
251 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  27.88 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  27.98 
 
 
245 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>