258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29470 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  86.4 
 
 
250 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  69.32 
 
 
254 aa  338  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  57.37 
 
 
255 aa  278  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  52.21 
 
 
250 aa  252  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  52.36 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  49.4 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  52.24 
 
 
248 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  51 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  50.6 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  49.8 
 
 
254 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  45.27 
 
 
253 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  47.58 
 
 
253 aa  215  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  49.58 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  45.49 
 
 
269 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  46.28 
 
 
256 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  46.09 
 
 
249 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 
264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  38.31 
 
 
252 aa  191  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
250 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  37.6 
 
 
255 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  38.82 
 
 
249 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  37.55 
 
 
249 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
246 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  32.92 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  31.1 
 
 
405 aa  72.4  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  41.6 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  25.81 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  38.93 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  29.66 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  32.58 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  31.82 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  33.53 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  39.85 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  31.06 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  31.06 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  31.06 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.39 
 
 
308 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  37.5 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  28.03 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  38.4 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  35.96 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  39.23 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  38.35 
 
 
255 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  37.6 
 
 
242 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  27.98 
 
 
311 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 
312 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 
283 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  34.62 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  33.73 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  35.71 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  20.26 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  34.78 
 
 
268 aa  52.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0450  methyltransferase type 12  29.13 
 
 
263 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  35.81 
 
 
268 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
260 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  20.44 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  26.42 
 
 
318 aa  52.4  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  28.91 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  22.69 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  41.44 
 
 
358 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  29.01 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0301  Methyltransferase type 12  31.71 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
257 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  37.01 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  32.03 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 
319 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  23.15 
 
 
273 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.56 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
212 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.46 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
348 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
284 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  28.64 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.97 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  33.88 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>