222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3953 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  86.4 
 
 
250 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  70.78 
 
 
254 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  59.29 
 
 
255 aa  289  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  54.22 
 
 
250 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  50.6 
 
 
250 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  53.01 
 
 
255 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  53.88 
 
 
248 aa  245  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  53.01 
 
 
255 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  52.23 
 
 
256 aa  246  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  52.24 
 
 
254 aa  241  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  46.5 
 
 
253 aa  231  8.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  49.41 
 
 
253 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  48.16 
 
 
269 aa  223  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  49.59 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  49.38 
 
 
249 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  48.76 
 
 
253 aa  214  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  38.55 
 
 
256 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  38.55 
 
 
256 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  38.62 
 
 
264 aa  195  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
252 aa  192  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
250 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  39.92 
 
 
255 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  40.08 
 
 
249 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  40.08 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
246 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  33.75 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  41.22 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  34.85 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  30.91 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  39.06 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  41.22 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  42.4 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  36.09 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  40.8 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  35.34 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  35.34 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  35.34 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  35.34 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  31.03 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  38.24 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  30.28 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  39.2 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
267 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  41.22 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  36.15 
 
 
255 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  36.84 
 
 
255 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
257 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
257 aa  58.5  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  36.76 
 
 
255 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  37.6 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  23.75 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  23.55 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  37.1 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.04 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  23.12 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  37.61 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  28.47 
 
 
311 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 
277 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  26.89 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  39.52 
 
 
260 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  32.28 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3479  methyltransferase type 11  41.03 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0924796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  38.21 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  35.09 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  25.46 
 
 
273 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  25.57 
 
 
283 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  23.18 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 
283 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  34.53 
 
 
268 aa  52.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  37.86 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  32.82 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.16 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  35.77 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 
312 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 
239 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>