79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0750 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  550  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  40.5 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  37.34 
 
 
253 aa  168  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  35.68 
 
 
269 aa  168  9e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  36.51 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 
246 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  34.98 
 
 
264 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  32.92 
 
 
246 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
252 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 
253 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  34.02 
 
 
254 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
250 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  33.75 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 
255 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  30.29 
 
 
254 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  32.92 
 
 
250 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  33.33 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  31.58 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  33.47 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  29.88 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  31.4 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
256 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
249 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  25.31 
 
 
253 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 
305 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
254 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 
256 aa  55.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  29.11 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  34.65 
 
 
205 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
198 aa  50.4  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.63 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  29.63 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  29.63 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.43 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.63 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.63 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.63 
 
 
261 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.63 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  28.35 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.86 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.11 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  27.74 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  29.41 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  26.45 
 
 
251 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  26.12 
 
 
256 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.86 
 
 
208 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  28.67 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  24.03 
 
 
217 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  30 
 
 
264 aa  45.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
252 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  25.62 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  25.62 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  25.62 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  26.45 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.88 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  27.94 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  34.02 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  26 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  25.56 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  26.47 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
214 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 
264 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.12 
 
 
200 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
243 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  29.51 
 
 
255 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>