234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3133 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  43.98 
 
 
253 aa  206  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  42.39 
 
 
248 aa  201  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 
269 aa  192  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  40.74 
 
 
250 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  38.37 
 
 
256 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  39.75 
 
 
250 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  38.37 
 
 
253 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  37.86 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  38.59 
 
 
264 aa  183  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
255 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  39.68 
 
 
255 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
255 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  38.52 
 
 
254 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  35.8 
 
 
254 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  36.99 
 
 
256 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  38.53 
 
 
263 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  39.51 
 
 
250 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  36.73 
 
 
249 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
246 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  36.07 
 
 
255 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  34.69 
 
 
249 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  36.48 
 
 
253 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  34.02 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  34.31 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  33.58 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  32.84 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  32.84 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  36 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  32.09 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  32.09 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  32.09 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  34.96 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.2 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  27.96 
 
 
305 aa  63.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.08 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.31 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  33.08 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.08 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.08 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  33.08 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.08 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  24.07 
 
 
405 aa  62.4  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  27.84 
 
 
242 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.62 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.85 
 
 
261 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.64 
 
 
245 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
275 aa  58.5  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  30.51 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  28.69 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
256 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  23.25 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  24.42 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.16 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  24.54 
 
 
265 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  32.33 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0301  Methyltransferase type 12  25.64 
 
 
243 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  35.87 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  32.8 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
254 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  29.08 
 
 
310 aa  52.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.04 
 
 
308 aa  52.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
254 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.55 
 
 
254 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.23 
 
 
254 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
254 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4018  methyltransferase  53.49 
 
 
89 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000287879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
254 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.65 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>