150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0048 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  52.42 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  47.51 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  45.6 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  49.19 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  48.37 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  48.16 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  44.94 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  44.53 
 
 		 250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  39.76 
 
 		 256 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  39.76 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  41.7 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  45.49 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  44.49 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  43.27 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  44.08 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  46.96 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  43.21 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  41.5 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  43.03 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  44.49 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  41.95 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  35.68 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  35.91 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  25.17 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  24.73 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  29.22 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  38.06 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  36.57 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0450  methyltransferase type 12  26.98 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  37.88 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  32.33 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  32.33 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  32.33 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  32.33 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  32.33 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.38 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  32.33 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  26.73 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  37.23 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  31.58 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  35.82 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  37.69 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  39.53 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  35.38 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  32.19 
 
 		 354 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 349 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  36.29 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.16 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 243 aa  52.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.9 
 
 		 239 aa  52.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  22.41 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3499  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  34.62 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.64 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  30.82 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  31.58 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 259 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  26.28 
 
 		 405 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  26.71 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  34.95 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3479  methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924796 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  39.56 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  27.86 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>